無(wú)義介導(dǎo)的RNA降解（Nonsense-mediated decay, NMD）是真核生物一種重要的mRNA質(zhì)量控制方式，細(xì)胞通過(guò)檢驗(yàn)終止密碼子與最后一個(gè)剪接接頭的距離是否超過(guò)55nt來(lái)判斷該終止密碼子是否為提前終止密碼子（Premature Termination Codon, PTC）從而決定是否降解該RNA。因此經(jīng)典的NMD通路是一種RNA剪接依賴的機(jī)制。假基因是一種失去了蛋白編碼能力或者表達(dá)能力的基因，通常由基因重復(fù)產(chǎn)生，基因組上的DNA重復(fù)可以形成非加工型假基因，而逆轉(zhuǎn)錄形成的基因重復(fù)會(huì)形成加工型假基因。假基因容易形成截短的蛋白產(chǎn)生細(xì)胞毒性，因此假基因的活性通常受到抑制。由于假基因通常含有PTC, 因此大量的非加工型假基因可以通過(guò)NMD的方式降解。然而，加工型假基因由于缺少內(nèi)含子而不能通過(guò)NMD的機(jī)制降解，那么加工型的假基因是否進(jìn)化出其他的方式來(lái)進(jìn)行降解并不清楚。中山大學(xué)王金凱教授團(tuán)隊(duì)揭示假基因的m6A RNA修飾受到達(dá)爾文正向選擇的研究成果在《Genome Biology》發(fā)表-肽度TIMEDOO
近日，中山大學(xué)王金凱教授課題組在Genome Biology雜志發(fā)表題為“Positive natural selection of N6-methyladenosine on the RNAs of processed pseudogenes”論文揭示加工型假基因在進(jìn)化過(guò)程中在達(dá)爾文正向選擇的驅(qū)動(dòng)下快速積累產(chǎn)生m6A motif 的突變，從而造成加工型假基因的m6A水平顯著高于同源的蛋白編碼基因，進(jìn)化出利用m6A降解加工型假基因的方式。這些進(jìn)化出的m6A位點(diǎn)對(duì)于降解加工型假基因防止其通過(guò)ceRNA的機(jī)制干擾同源蛋白編碼基因的表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)發(fā)揮了重要作用。該論文的第一作者為王金凱教授課題組的兩名博士研究生譚利強(qiáng)和程維晟同學(xué)。
中山大學(xué)王金凱教授團(tuán)隊(duì)揭示假基因的m6A RNA修飾受到達(dá)爾文正向選擇的研究成果在《Genome Biology》發(fā)表-肽度TIMEDOO
這項(xiàng)工作揭示了m6A RNA修飾的新的進(jìn)化意義，即通過(guò)降解加工型假基因來(lái)緩解加工型假基因?qū)ν吹鞍拙幋a基因表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的干擾，為進(jìn)一步揭示假基因的m6A修飾在人類疾病中的作用和機(jī)理奠定了基礎(chǔ)。該工作得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金和廣州市科技計(jì)劃的支持。
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論文原文鏈接為：https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-021-02402-2
來(lái)源：中山醫(yī)學(xué)院