2022年6月14-17日|生物醫(yī)學公共數據深度挖掘及應用培訓班

4年前發(fā)布在 培訓班

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還在認為沒有實驗就不能發(fā)表論文？

手頭有很多數據，不知道該怎么進一步挖掘？

還在為不知道如何找靶點而苦惱？

還在為不精通挖掘GEO、TCGA等數據庫而痛苦不堪？

還在為不會那些高大上的圖表而暗自傷神？

快來參加北京市計算中心舉辦的生物醫(yī)學公共數據深度挖掘及應用培訓班吧！

本次培訓對目前公共數據挖掘熱點進行系統介紹，提供一次系統了解TCGA、GEO、SRA、ENCODE等數據庫數據產生、分析及挖掘的課程。通過大量演練操作，幫助科研人員利用這些公共數據庫挖掘多組學數據，以便為自身科研項目服務。歡迎報名參加。更多消息可關注“生信會議”公眾號，會給您帶來更多驚喜！

授課對象：

從事生物醫(yī)學研究的臨床醫(yī)生、轉化研究科研人員；

課題經費不足，無法進行大規(guī)模測序，但需要發(fā)表SCI論文的相關研究人員；

已獲得轉錄組、基因組等多組學數據，需要進一步挖掘分析人員；

對生物醫(yī)學大數據分析與挖掘感興趣的其他人員。

培訓效果：

短、平、快，為基金申請保駕護航，發(fā)表paper如虎添翼；

掌握多組學數據分析核心技能，GEO、TCGA、SRA數據處理沒有壓力；

科研繪圖：以一敵百，高端大氣，私人訂制；

一套數據多角度演練，更易掌握分析思路。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協辦單位：北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心

云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地

北京市大數據教學實踐基地

舉辦地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產業(yè)3號樓

課程安排：2022年6月14日-17日（周二–周五）上午9:30-11:30 ?下午13:30-17:00

時間	主題	授課內容	備注
第一天	組學及生物信息學概述	1、組學研究概述（基因組學，轉錄組學，表觀組學，蛋白質組學，代謝組學及相關技術介紹） 2、實驗設計及測序原理 3、生物信息學背景知識介紹	理論
	公共數據庫挖掘熱點介紹	4、人工智能研究在病理切片識別上的應用 5、人工智能多組學數據整合分析	理論
	常用生物醫(yī)學數據庫介紹	6、用生物醫(yī)學數據庫介紹：（1）大型綜合數據庫：NCBI、UCSC （2）公共高通量測序數據庫：SRA （3）公共基因表達譜數據庫：GEO （4）公共癌癥多組學數據庫：TCGA 7、各大數據庫數據下載	理論+演示
第二天	R語言入門	8、R語言簡介 9、R語言安裝及配置 10、R語言數據結構 11、R語言數據處理 12、R語言繪圖	理論+實操
第二天	基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（一）	13、差異表達分析及結果可視化：（1）edgeR包使用（2）火山圖繪制（3）聚類熱圖繪制 14、GO、KEGG功能富集分析及結果可視化：（1）GO富集分析（2）KEGG富集分析（3）富集分析氣泡圖繪制	理論+實操
第三天	基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（二）	15、預后相關性分析、生存曲線、ROC曲線繪制：（1）利用R包進行單因素及多因素預后分析（2）生存曲線繪制、生存曲線差異顯著性分析（3）RISK score計算及結果可視化	理論+實操
	基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（三）	16、利用string數據庫查詢基因/蛋白相互作用 17、網絡拓撲結構分析、關鍵基因識別	理論+實操
	基于公共數據的Biomarker挖掘鑒定演練（三）	18利用cytoscape工具構建相互作用網絡	實操
第四天	多組學數據聯合分析演練（一）	19、表觀組高通量數據原理 20、甲基化與轉錄組整合分析思路 21、表觀組公共數據庫：ENCODE、regulomeDB	理論
	多組學數據聯合分析演練（一）	22、甲基化數據預處理 23、差異甲基化位點及區(qū)域識別 24、差異分析結果可視化	實操
	多組學數據聯合分析演練（二）	25、lncRNA-miRNA-mRNA全轉錄組整合分析思路演練（1）lncRNA表達譜數據獲取（2）miRNA靶基因分析（3）lncRNA與mRNA表達相關性分析（4）ceRNA網絡構建及結果可視化	理論+實操