2023年7月22-28日浙江大學第62期“基因組科學”研習班

2年前發(fā)布在 培訓班

開班時間：7月22-28日（22日全天報道，23日起授課）上課內容：基因組學、系統(tǒng)生物學、基因組與精準醫(yī)學上機實習：1.基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析；2.轉錄組數(shù)據(jù)分析；3.蛋白質結構與功能分析；4.蛋白質組學數(shù)據(jù)分析；5.系統(tǒng)生物學。

? ? ? ?研習班創(chuàng)始于2003年10月，由DNA雙螺旋結構的發(fā)現(xiàn)者詹姆斯·杜威·沃森教授與浙江大學沃森研究院首任院長楊煥明教授共同創(chuàng)辦，2007年后由浙江大學浙江加州國際納米技術研究院繼續(xù)承辦，研習班旨在通過基因組、蛋白質組、系統(tǒng)生物學等內容的系統(tǒng)講授，為學員打開生物信息學的全新領域。教授團隊聯(lián)袂授課：著名基因組學專家于軍研究員、中科院微生物所胡松年研究員講授基因組學基礎知識和前沿進展、基因轉錄組的測定及分析、基因芯片、二代測序等實驗技術的關鍵事項；浙江大學生科院陳銘教授、浙江大學農學院徐建紅教授、浙江大學農學院張亮生求是特聘教授、浙江大學生研院周青研究員（美國臨床分子遺傳學執(zhí)業(yè)主任醫(yī)師）、浙江大學“百人計劃”俞曉敏研究員、楊軍教授等講解系統(tǒng)生物學、表觀基因組學及高通量分析研究方法和思路。百人平臺攜手科研：至今我們已舉辦61期，每期近百人，學員遍布全國30余個省市。每次研習班都有近30%教授、研究員等高級職稱技術人員參加。他們中有一些帶著課題或問題前來交流和聯(lián)系；也有的通過研習班建立了協(xié)作關系，共同申請課題，發(fā)表論文，其中不少優(yōu)秀研究成果，已在SCI期刊上發(fā)表。

2023年7月22-28日浙江大學第62期“基因組科學”研習班-肽度TIMEDOO

一、培訓班上課內容、

上課內容涵蓋“基因組學—蛋白質組學—系統(tǒng)生物學”的研究方法、技術思路、前沿進展及其在各生物學科中的應用。

核心課程包括：

1. 基因組的比較研究? ? （于軍教授）

2. 大規(guī)模測序方法及應用、微生物基因組學、基因組學與精準醫(yī)學（胡松年教授）

3. 系統(tǒng)生物學導論及高通量分析技術應用（楊軍?教授）

4. 系統(tǒng)生物學建模分析（陳銘?教授）

5.?比較基因組學應用（徐建紅教授）

6.??動植物基因組進化（張亮生教授）

7.遺傳學在疑難未診斷疾病中的應用（俞曉敏研究員）

8.??基因組學在醫(yī)學中的應用（周青? 教授）

2023年7月22-28日浙江大學第62期“基因組科學”研習班-肽度TIMEDOO

二、培訓班上機內容

本研習班上機實習課采用 “跟我學”方式，學習實踐各類基礎生物信息學軟件，每人一臺PC機跟著大屏幕一步步學會基因組、蛋白質組學數(shù)據(jù)分析的基本方法。

主要內容如下：

實習一：基因組數(shù)據(jù)注釋和功能分析

通過序列比對工具BLAST的學習，了解基因功能注釋的原理；介紹多序列聯(lián)配工具ClustalX及分子進化分析軟件MEGA4，掌握系統(tǒng)發(fā)生樹繪制的基本方法，認識基因復制在進化上的功能；學習基因序列分析常用的數(shù)據(jù)庫和軟件。

實習二：轉錄組數(shù)據(jù)分析

介紹轉錄組數(shù)據(jù)分析的基本流程及其原理；通過對tophat、cufflinks、R等轉錄組數(shù)據(jù)分析工具的介紹及演示，了解基于二代測序數(shù)據(jù)的轉錄組分析流程及常用分析方法；利用kegg、GOstat、DAVID等在線工具挖掘轉錄組數(shù)據(jù)的生物學意義。

實習三：蛋白質結構與功能分析

從數(shù)據(jù)庫搜索感興趣的蛋白質氨基酸序列開始，接著對蛋白質基本理化性質、二級結構、和三維空間結構和序列模體進行分析，預測目標蛋白的生物功能。

實習四：蛋白質組學數(shù)據(jù)分析

使用X！Tandem、Mascot、Sequest等軟件鑒定蛋白質質譜數(shù)據(jù)，將質譜結果匹配到蛋白質組數(shù)據(jù)庫鑒定蛋白；使用TPP軟件包進行統(tǒng)計學分析和優(yōu)化檢索結果練習。

實習五：系統(tǒng)生物學軟件實習—–網絡結構顯示與分析

利用Cytoscape系統(tǒng)生物學分析軟件，分析蛋白－蛋白相互作用，展示分子網絡系統(tǒng)，并與基因表達等數(shù)據(jù)整合。