2024.4.15-19·全面理解，系統(tǒng)解釋：實用生物信息學研討班

2年前發(fā)布在 培訓班

2024.4.15-19·全面理解，系統(tǒng)解釋：實用生物信息學研討班-肽度TIMEDOO

生物信息學是一門新興的交叉學科，它的出現和發(fā)展，與生物技術的迅速發(fā)展密不可分。生物信息學可以幫助我們理解生命科學領域中的大量數據，包括基因、基因組、蛋白質、代謝等多個層面的信息。掌握生物信息學的相關知識和技能，可以幫助我們更好地理解和解釋生物醫(yī)學數據，并為生命科學研究提供重要支持。

本期實用生物信息學研討班是一個系統(tǒng)、全面的培訓課程，旨在幫助生物醫(yī)學研究者和生物信息學初學者全面掌握生物信息學相關的知識和技能，包括生物信息學和各組學知識以及多類測序數據的實例分析等。如有更多關注信息或是科研難點問題，可與授課老師進行互動討論。

主辦單位：北京市計算中心有限公司

協(xié)辦單位：

北京市基因測序與功能分析工程技術研究中心

云計算關鍵技術與應用北京市重點實驗室

工業(yè)和信息化人才培養(yǎng)工程培訓基地

北京市大數據教學實踐基地

舉辦地：北京市海淀區(qū)豐賢中路7號北科產業(yè)3號樓

課程安排：2024年4月15-19日（周一—周五）??上午9:30-12:00 ?下午13:30-17:00

日期	主題	內容	備注
第一天	組學及生物信息學概述	1、組學研究概述（基因組學、轉錄組學、表觀組學、蛋白質組學、代謝組學及相關技術介紹） 2、實驗設計及測序原理 3、生物信息學背景知識介紹	理論
	Linux服務器使用入門	1、掌握Linux系統(tǒng)下的常用命令（重點講解） 2、掌握Linux環(huán)境下軟件的安裝使用 3、了解Shell腳本的編寫	實戰(zhàn)
	R語言入門	1、R語言簡介 2、R語言安裝及配置 3、R語言數據結構 4、R語言數據處理 5、R語言繪圖	理論+ 實戰(zhàn)
第二天	轉錄組數據分析	1、轉錄組技術發(fā)展前沿動態(tài) 2、轉錄組應用案例及應用熱點 3、常用的轉錄組實驗設計及測序建庫技術 4、轉錄組分析方法介紹	理論
第二天	轉錄組數據分析實例（上機操作）	1、轉錄組數據準備和軟件介紹及安裝 2、轉錄組數據的比對（重點講解） 3、表達量估計和分析（重點講解）	理論+ 實戰(zhàn)
第三天	基因組重測序與數據分析	1、講解基因組重測序的概念、目的與應用 2、結合實例講解其原理、數據類型與格式、操作流程、軟件等相關知識	理論
第三天	基因組重測序數據分析實例（上機操作）	1、對二代測序數據的解讀 2、數據質量控制及數據過濾 3、使用BWA和Samtools進行數據比對并對比對結果進行可視化（重點講解） 4、尋找SNP和Indel并進行注釋（重點講解） 5、尋找結構變異并對變異進行注釋（重點講解）	理論+ 實戰(zhàn)
第四天	microRNA測序與數據分析	1、microRNA的定義、應用和發(fā)展 2、microRNA的生物學過程 3、microRNA研究的實驗設計及測序原理 4、microRNA測序數據分析軟件（重點講解） 5、microRNA目前的挑戰(zhàn)以及將來的研究前景 6、microRNA測序數據分析案例展示（重點講解） 7、近期文獻	理論
第四天	microRNA數據分析實例（上機操作）	1、microRNA測序數據預處理（重點講解） 2、測序數據長度分布計算 3、microRNA的預測（重點講解） 4、microRNA堿基偏好性計算 5、microRNA靶標基因預測，結果提取、統(tǒng)計（重點講解）	理論+ 實戰(zhàn)
第五天	10×單細胞轉錄組測序數據分析原理	1、單細胞測序技術研究現狀及應用 2、單細胞轉錄組實驗設計及建庫測序原理（重點介紹10× Genomics） 3、空間轉錄組實驗設計及建庫測序原理	理論
	10×單細胞轉錄組測序數據分析流程上機操作	1、10×單細胞軟件Cellranger處理測序原始數據實戰(zhàn) 2、R包Seurat細胞分群、umap、t-sne、marker基因篩選實戰(zhàn)	實戰(zhàn)
	蛋白結構與互作分析	1、PyMOL 2、Cytoscape	實戰(zhàn)