1月22日，國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心正式發(fā)布2019新型冠狀病毒資源庫(kù)。該庫(kù)整合了世界衛(wèi)生組織（WHO）、中國(guó)疾病預(yù)防控制中心（CDC）、美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心（NCBI）、全球流感序列數(shù)據(jù)庫(kù)（GISAID）等機(jī)構(gòu)公開(kāi)發(fā)布的冠狀病毒基因組序列數(shù)據(jù)、元信息、學(xué)術(shù)文獻(xiàn)、新聞動(dòng)態(tài)、科普文章。同時(shí)，對(duì)不同冠狀病毒株的基因組序列做了變異分析與展示。

2019新型冠狀病毒資源庫(kù)收錄了來(lái)源于NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)和GISAID數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)布的2019新型冠狀病毒（2019-nCoV）病毒株的株名、采樣日期、采樣地點(diǎn)、樣本提供單位、數(shù)據(jù)遞交單位等元信息。通過(guò)該資源庫(kù)還可訪問(wèn)到國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心基因組數(shù)據(jù)庫(kù)GWH從公共數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的冠狀病毒科基因組和蛋白序列，用戶可基于Accession號(hào)、種名、屬名、采樣日期、采樣地點(diǎn)、宿主、分離源、發(fā)布日期等元信息篩選感興趣的冠狀病毒株，個(gè)性化選取序列進(jìn)行下載以開(kāi)展相關(guān)的科學(xué)研究。

2019新型冠狀病毒資源庫(kù)將持續(xù)更新元信息與基因組序列數(shù)據(jù)，實(shí)時(shí)監(jiān)控NCBI的PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)表的2019新型冠狀病毒和其他冠狀病毒的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)、中新網(wǎng)與新華網(wǎng)發(fā)布的新聞，同步更新世界衛(wèi)生組織與中國(guó)疾病預(yù)防控制中心發(fā)布的科普介紹，為用戶開(kāi)展學(xué)術(shù)研究、掌握科研進(jìn)展、了解新聞動(dòng)態(tài)與科學(xué)知識(shí)提供資源與窗口。

2019新型冠狀病毒資源庫(kù)基于不同參考基因組序列開(kāi)展2019-nCoV病毒株基因組變異分析，并對(duì)結(jié)果進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)與可視化展示。通過(guò)對(duì)全基因組序列相似性比較和變異位點(diǎn)分析，獲取2019-nCoV病毒株之間、2019-nCoV病毒株與SARS冠狀病毒以及與類SARS冠狀病毒蝙蝠株之間的變異程度、變異區(qū)域、變異堿基的詳細(xì)信息。經(jīng)數(shù)據(jù)分析，2019-nCoV與2003年爆發(fā)的SARS病毒基因組序列相似度為80%，與2017年2月從國(guó)內(nèi)的蝙蝠中采集到的Bat SARS-like coronavirus isolate bat-SL-CoVZC45基因組序列相似性最高，相似度為88%。對(duì)2019-nCoV病毒株的基因組變異分析為追溯病毒來(lái)源、追蹤病毒株變異路徑、防控新型冠狀病毒引發(fā)的疫情、治療病毒性肺炎提供重要的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)與決策支持。

2019新型冠狀病毒基因組序列發(fā)布動(dòng)態(tài)

GWH數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的冠狀病毒科基因組序列信息

　　2019新型冠狀病毒基因組變異分析：基因組變異分析的參考基因組為GenBank發(fā)布的2019新型冠狀病毒株基因組序列MN908947.3，SARS-Cov為SARS 冠狀病毒，bat-SL-CoVZC45為類SARS冠狀病毒蝙蝠株，其余基因組序列來(lái)源于GISAID發(fā)布的2019新型冠狀病毒株。紅色豎線表示變異位點(diǎn)。

來(lái)源： 北京基因組研究所