隨著細(xì)胞重編程、基因編輯、合成生物學(xué)、高通量測(cè)序等技術(shù)的快速發(fā)展，再生生物學(xué)進(jìn)入前所未有的蓬勃發(fā)展時(shí)期，助力解決組織替代、功能修復(fù)、衰老干預(yù)、疾病治療等一系列生命醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的重要科學(xué)難題。面對(duì)科學(xué)數(shù)據(jù)的爆炸式增長(zhǎng)，亟需建立以再生生物學(xué)為核心的開放數(shù)據(jù)庫(kù)，以存儲(chǔ)世界范圍內(nèi)的組學(xué)研究數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，推動(dòng)再生相關(guān)的基礎(chǔ)研究和臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用的不斷發(fā)展。

9月30日，中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所（國(guó)家生物信息中心）鮑一明研究組、張維綺研究組和中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組合作，在Nucleic Acids Research 雜志發(fā)表論文，建立了再生生物學(xué)領(lǐng)域首個(gè)多組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)Regeneration Roadmap。該數(shù)據(jù)庫(kù)從轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、表觀基因組及藥物基因組等不同層面整合了再生相關(guān)數(shù)據(jù)集，涉及11個(gè)物種、36種組織類型，實(shí)現(xiàn)了不同條件下基因表達(dá)隨再生變化的匯聚融合，以及對(duì)不同層次組學(xué)數(shù)據(jù)的交互查詢和聯(lián)合比較分析。此外，數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了基于已有文獻(xiàn)報(bào)道的再生相關(guān)基因集，使得用戶可以更加深入全面地了解特定基因或通路在再生生物學(xué)中的功能。

Regeneration Roadmap數(shù)據(jù)庫(kù)實(shí)現(xiàn)了對(duì)多物種再生相關(guān)的不同層次組學(xué)數(shù)據(jù)的收錄與整合。作為一個(gè)持續(xù)更新的國(guó)際化信息平臺(tái)，Regeneration Roadmap的建立為國(guó)內(nèi)外再生生物學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)的統(tǒng)一匯交、集中存儲(chǔ)、安全管理、開放共享以及前沿交叉研究和臨床轉(zhuǎn)化應(yīng)用提供了助力和支撐。該數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)用戶免費(fèi)開放，相關(guān)運(yùn)維團(tuán)隊(duì)將對(duì)該數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行定期維護(hù)與更新，不斷整合更多的再生相關(guān)數(shù)據(jù)資源、匯交多層次組學(xué)數(shù)據(jù)。此外，該團(tuán)隊(duì)于2020年建立了Aging Atlas（AA）數(shù)據(jù)庫(kù)，收錄和整合了與衰老相關(guān)的不同層次多組學(xué)數(shù)據(jù)。目前Aging Atlas數(shù)據(jù)庫(kù)已服務(wù)來(lái)自全球25個(gè)國(guó)家的上萬(wàn)名訪問(wèn)者。Aging Atlas和Regeneration Roadmap數(shù)據(jù)庫(kù)將形成資源互補(bǔ)，共同推動(dòng)衰老生物學(xué)和再生生物學(xué)的學(xué)科發(fā)展。

Regeneration Roadmap數(shù)據(jù)庫(kù)由中科院北京基因組所（國(guó)家生物信息中心）、中科院動(dòng)物所、中科院干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)科學(xué)數(shù)據(jù)中心、中科院干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)創(chuàng)新研究院、北京干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究院、首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院國(guó)家老年疾病臨床研究中心等機(jī)構(gòu)合作完成。該項(xiàng)目獲得科技部、國(guó)家自然科學(xué)基金委、中科院和北京市等項(xiàng)目的資助。

論文鏈接

Regeneration Roadmap數(shù)據(jù)庫(kù)

來(lái)源： 北京基因組研究所