全基因組測(cè)序提高罕見(jiàn)病診斷率
每4300人中就有1人患有線粒體疾病,并會(huì)導(dǎo)致進(jìn)行性的不治之癥。這種疾病是最常見(jiàn)的遺傳疾病之一,但對(duì)臨床醫(yī)生來(lái)說(shuō)很難診斷,這是因?yàn)樗鼈兛梢杂绊懺S多不同的器官,并與許多其他疾病相似。而其中40%的患者未能被目前的基因檢測(cè)制度診斷。
近日,英國(guó)研究人員的一項(xiàng)新研究為尚不能被確診的患者帶來(lái)了希望。該研究發(fā)現(xiàn),單次血液檢測(cè)的全基因組測(cè)序檢測(cè)出的罕見(jiàn)遺傳疾病病例比標(biāo)準(zhǔn)檢測(cè)多31%,并支持英國(guó)建立一個(gè)基于全基因組測(cè)序的國(guó)家診斷計(jì)劃,以更快地診斷更多疾病。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表于11月4日《英國(guó)醫(yī)學(xué)雜志》。
雖然之前基于小范圍、高選擇性隊(duì)列的研究表明,WGS可以識(shí)別線粒體疾病,但這是第一次在國(guó)家醫(yī)療保健系統(tǒng)中檢驗(yàn)其有效性。
該研究涉及319個(gè)疑似線粒體疾病的家庭,總共345名參與者,年齡范圍為0~92歲,平均年齡為25歲,均進(jìn)行了全基因組測(cè)序。通過(guò)不同的分析,研究人員發(fā)現(xiàn)他們可以對(duì)98個(gè)家庭(31%)做出明確或可能的遺傳診斷。98個(gè)家庭中有2%的家庭被診斷為6種可能的疾病??偣采婕暗?5個(gè)不同的基因。
令人驚訝的是,62.5%的診斷結(jié)果實(shí)際上是非線粒體疾病,這是因?yàn)樵S多不同的疾病都類似于線粒體疾病,使得人們很難分清。
英國(guó)醫(yī)學(xué)研究委員會(huì)線粒體生物研究組和劍橋大學(xué)臨床神經(jīng)科學(xué)系教授Patrick Chinnery教授說(shuō):“我們建議,在肌肉活檢等侵入性檢查之前,應(yīng)該盡早提供全基因組測(cè)序?!?/p>
研究人員的診斷結(jié)果中,有37.5%是由已知的線粒體疾病基因引起的。這些診斷幾乎都是特定家庭成員獨(dú)有的,反映了疾病的遺傳多樣性。
線粒體功能受損往往會(huì)影響高能量需求的組織,如大腦、周圍神經(jīng)、心臟等。然而,該團(tuán)隊(duì)的大多數(shù)診斷(62.5%)是非線粒體疾病,其特征類似線粒體疾病。如果只是通過(guò)肌肉活檢和/或特定的線粒體基因板對(duì)參與者進(jìn)行線粒體疾病調(diào)查,這些疾病就會(huì)被忽略。
Chinnery說(shuō):“這些病人被轉(zhuǎn)診是因?yàn)橐伤凭€粒體疾病,而傳統(tǒng)的診斷測(cè)試是專門(mén)針對(duì)線粒體疾病的。除非你考慮到其他的可能性,否則你不會(huì)診斷它們。全基因組測(cè)序不受這種偏見(jiàn)的限制。”
Chinnery表示,英國(guó)的診斷服務(wù)支離破碎,分布不均,這給罕見(jiàn)疾病患者及其家人帶來(lái)了重大挑戰(zhàn)。通過(guò)實(shí)施基于全基因組方法的國(guó)家規(guī)劃,可以向每個(gè)人提供同等水平的服務(wù)。
相關(guān)研究結(jié)果:https://doi.org/10.1136/bmj-2021-066288
來(lái)源:《英國(guó)醫(yī)學(xué)雜志》、中國(guó)科學(xué)報(bào)


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