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發(fā)現(xiàn)乳腺浸潤性微乳頭狀癌關(guān)鍵診療靶點(diǎn)！天津腫瘤醫(yī)院與華大研究院在《自然》子刊發(fā)文

3年前發(fā)布在 7X24h 資訊

近日，天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院與深圳華大生命科學(xué)研究院（以下簡稱華大研究院）的研究團(tuán)隊(duì)在《自然-通訊》（Nature Communications）上在線發(fā)表了題為“Genomic alterations and evolution of cell clusters in metastatic invasive micropapillary carcinoma of the breast”的文章。研究人員使用組織測序與細(xì)胞團(tuán)測序結(jié)合的方式，對乳腺浸潤性微乳頭狀癌（Invasive micropapillary carcinoma，IMPC）進(jìn)行檢測分析，描繪了其基因圖譜與進(jìn)化路徑，并篩選出與癌癥轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因，進(jìn)行臨床驗(yàn)證，為臨床診療提供了潛在靶點(diǎn)，助力精準(zhǔn)醫(yī)療。

發(fā)現(xiàn)乳腺浸潤性微乳頭狀癌關(guān)鍵診療靶點(diǎn)！天津腫瘤醫(yī)院與華大研究院在《自然》子刊發(fā)文-肽度TIMEDOO

Nature Communications 官網(wǎng)截圖

浸潤性微乳頭狀癌是一種特殊病理類型的腫瘤，容易侵襲淋巴、血管，并發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。在乳腺癌中，浸潤性微乳頭狀癌占比約為6%，在肺、胃等器官的腫瘤中也有浸潤性微乳頭狀癌的報道。之前的相關(guān)研究缺少對浸潤性微乳頭狀癌高轉(zhuǎn)移、高侵襲能力的基因組學(xué)機(jī)制的探究，本研究即從這一關(guān)鍵點(diǎn)切入，進(jìn)行探索。

IMPC的形態(tài)學(xué)特征，左圖為H&E染色，右圖為上皮細(xì)胞膜抗原（EMA）染色

為了從基因?qū)用骊U明IMPC的病理特征及轉(zhuǎn)移機(jī)制，研究團(tuán)隊(duì)選取17例乳腺IMPC患者的樣本組織進(jìn)行全外顯子測序，同時，在29例患者的樣本上使用激光顯微切割（LCM）和空間定位細(xì)胞團(tuán)測序技術(shù)，分割了442個帶有空間定位信息的細(xì)胞團(tuán)并進(jìn)行全基因組測序。

通過對組織進(jìn)行測序，研究團(tuán)隊(duì)描繪了IMPC的突變圖譜及基因變化特征，并發(fā)現(xiàn)拷貝數(shù)變化與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)。通過對細(xì)胞團(tuán)測序，研究團(tuán)隊(duì)比較了純型與非純型IMPC的基因特征，發(fā)現(xiàn)在多個樣本中存在細(xì)胞團(tuán)間遺傳距離與物理距離不一致的現(xiàn)象（即在切片上距離遠(yuǎn)的細(xì)胞團(tuán)，基因組特征較為接近，切片上距離近的細(xì)胞團(tuán)，基因組特征反而差異較大），推測這可能與其生長模式相關(guān)。

研究團(tuán)隊(duì)還通過對細(xì)胞團(tuán)進(jìn)行分子演化分析，描述了IMPC發(fā)展的分子模式，并根據(jù)不同患者的比較，篩選出了3個與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)的基因，IGSF9, PRDM16和ALDH2，并在86例IMPC臨床樣本中進(jìn)行了驗(yàn)證，結(jié)果顯示IGSF9、PRDM16蛋白低表達(dá)及ALDH2蛋白高表達(dá)與IMPC高淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移及不良預(yù)后密切相關(guān)。

IMPC作為一種高轉(zhuǎn)移性的特殊類型腫瘤一直備受關(guān)注，本研究通過對IMPC全面系統(tǒng)的分析，揭示了其病理特征背后的分子機(jī)制，并通過尋找和驗(yàn)證與轉(zhuǎn)移相關(guān)的關(guān)鍵基因，為精準(zhǔn)檢測和治療提供了靶點(diǎn)。

天津市腫瘤醫(yī)院時倩倩博士、賈宏琴博士與華大研究院的邵康博士、曹博洋助理研究員為本文共同第一作者，天津市腫瘤醫(yī)院付麗教授、李帥教授和華大生命科學(xué)研究院河南分院執(zhí)行院長李貴波博士為共同通訊作者。

近期，華大研究院在乳腺癌研究領(lǐng)域取得多項(xiàng)進(jìn)展。除以上研究外，華大研究院還聯(lián)合深圳市人民醫(yī)院、西京醫(yī)院研究團(tuán)隊(duì)，使用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的方式，對接受乳腺癌新輔助化療（NAC）病人的腫瘤組織及外周血單核細(xì)胞進(jìn)行了測序，以構(gòu)建乳腺癌單細(xì)胞圖譜。研究發(fā)現(xiàn)，干擾素相關(guān)通路和基因的表達(dá)在NAC治療后顯著下調(diào)。從而推斷，NAC 通過抑制干擾素信號傳導(dǎo)來抑制循環(huán)系統(tǒng)中的免疫細(xì)胞活性。相關(guān)研究成果于《臨床與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)》（Clinical and Translational Medicine，影響因子11.492）上發(fā)表。

Clinical and Translational Medicine?網(wǎng)站截圖

該研究結(jié)果顯示，臨床中對于在NAC后產(chǎn)生免疫抑制的病人，可考慮結(jié)合免疫治療以重新激活免疫反應(yīng)來獲得更好的療效，同時，評估患者血液中的干擾素水平也可能成為一種指導(dǎo)NAC后治療策略的依據(jù)。

上述研究中涉及的基因組測序由華大自主研發(fā)的DNBSEQ測序平臺及其配套的自動化樣本制備系統(tǒng)完成。

DNBSEQ測序平臺采用先進(jìn)的DNA納米球測序核心技術(shù)，與其他現(xiàn)有測序技術(shù)相比，能更加有效的避免了PCR擴(kuò)增錯誤指數(shù)累計(jì)的問題，具備超高準(zhǔn)確度和敏感度、產(chǎn)出數(shù)據(jù)重復(fù)序列率低、無標(biāo)簽跳躍（index hopping）等平臺優(yōu)勢，有效的為該研究提供了助力。

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