一個供研究人員共享危險病毒基因組的新數(shù)據(jù)庫，有望解決許多阻礙現(xiàn)有方法的問題。但前提是，必須說服研究人員使用它。

據(jù)《自然》報道，這一名為Pathoplexus的數(shù)據(jù)庫于上個月啟動，數(shù)據(jù)庫背后的科學(xué)家團(tuán)隊希望有更多研究人員分享已知和新出現(xiàn)的對公共衛(wèi)生具有重要意義的基因序列。

澳大利亞悉尼大學(xué)病毒學(xué)家Edward Holmes說，盡可能快地共享序列對于識別新病毒、跟蹤其變異至關(guān)重要，同時也有助于疫苗設(shè)計。

Pathoplexus數(shù)據(jù)庫目前聚焦其他數(shù)據(jù)庫未包含的4種病毒：克里米亞-剛果出血熱病毒、蘇丹埃博拉病毒、扎伊爾埃博拉病毒和西尼羅河病毒。該團(tuán)隊表示，稍后還會在數(shù)據(jù)庫中添加其他病原體。

現(xiàn)有最大的數(shù)據(jù)庫之一是美國的GenBank，它允許無限制訪問。但是無限制訪問意味著理論上任何人都可以使用這些數(shù)據(jù)發(fā)表科學(xué)論文，而無需承認(rèn)數(shù)據(jù)所有者。這阻礙了科學(xué)家，特別是來自低收入國家的科學(xué)家在突發(fā)公共衛(wèi)生事件期間快速分享他們的數(shù)據(jù)。

另一個數(shù)據(jù)庫GISAID要求用戶注冊，同意承認(rèn)數(shù)據(jù)所有者并盡力與所有者合作，旨在確保數(shù)據(jù)提交者的權(quán)利。GISAID一度非常受歡迎，但研究人員對其治理透明度、如何調(diào)解關(guān)于誠信的爭議等提出了擔(dān)憂。

日本東京大學(xué)進(jìn)化病毒學(xué)家Spyros Lytras說：“在過去幾年里，GISAID遇到了很多挫折?！钡茖W(xué)界也吸取了教訓(xùn)。“從零開始是我們所需要的，Pathoplexus數(shù)據(jù)庫可能是解決方案?！?/p>

Pathoplexus數(shù)據(jù)庫為用戶提供了一些保護(hù)。例如，研究人員可以對他人如何使用他們的數(shù)據(jù)進(jìn)行限制，例如，不允許在沒有明確許可的情況下，在一年內(nèi)將他們的數(shù)據(jù)作為科學(xué)出版物的重點。這應(yīng)該為數(shù)據(jù)所有者留足了時間來提交他們的研究成果初稿。

用戶還必須在他們的出版物中注明數(shù)據(jù)所有者?！拔覀兊哪繕?biāo)是建立一個社區(qū)，讓研究人員確信他們的貢獻(xiàn)將得到尊重和適當(dāng)認(rèn)可?！盤athoplexus數(shù)據(jù)庫團(tuán)隊成員、全球基因組流行病學(xué)公共衛(wèi)生聯(lián)盟運(yùn)營負(fù)責(zé)人Jamie Southgate說。

Pathoplexus不會阻止違反使用條款的個人訪問該網(wǎng)站，而GISAID在極少數(shù)情況下會這樣做。相反，如果發(fā)布的數(shù)據(jù)違反了條款，該團(tuán)隊將聯(lián)系期刊，確保數(shù)據(jù)按照共享方式使用。Pathoplexus數(shù)據(jù)庫的聯(lián)合創(chuàng)始人、瑞士熱帶和公共衛(wèi)生研究所分子流行病學(xué)家Emma Hodcroft說：“我們盡力讓條款十分明確。”

孟加拉兒童健康研究基金會分子微生物學(xué)家Senjuti Saha同意聯(lián)系出版商的方法?！斑@是一個很好的、聰明的解決方案?！彼J(rèn)為，Pathoplexus數(shù)據(jù)庫的透明度將在科學(xué)界中建立信任。

Saha強(qiáng)調(diào)，現(xiàn)在說Pathoplexus存儲庫能否解決當(dāng)前的數(shù)據(jù)共享問題還為時過早?！暗@是非常棒的第一步?！?/p>

Pathoplexus的創(chuàng)建者盡力改進(jìn)用戶體驗，例如盡可能簡化上傳過程。Pathoplexus數(shù)據(jù)庫還會檢查序列數(shù)據(jù)和相關(guān)信息的錯誤，并幫助將病毒組織成亞型。

目前，已經(jīng)有數(shù)千人訪問了該數(shù)據(jù)庫，有50人創(chuàng)建了賬戶提交數(shù)據(jù)，但沒有人提交序列。為了擴(kuò)大規(guī)模，Pathoplexus數(shù)據(jù)庫團(tuán)隊需要獲得長期資金。Hodcroft說，現(xiàn)在的首要任務(wù)是吸引捐助者，“我抱著謹(jǐn)慎的希望”。

來源：中國科學(xué)報